List BEDsets — bb_list_bedsets • bedbaser

List BEDsets available through bedhost. By default uses the bedhost default of 1000 records and an initial offset of 0.

bb_list_bedsets(bedbase, query = "", limit = 1000, offset = 0)

Arguments

bedbase: BEDbase() object
query: character() (default "") keyword
limit: integer(1) (default 1000) maximum records
offset: integer(1) (default 0) page token of records

Value

tibble of BEDset records

Examples

bedbase <- BEDbase()
#> 125977 BED files available.
bb_list_bedsets(bedbase)
#> # A tibble: 1,000 × 9
#> # Groups:   id, name, md5sum, submission_date, last_update_date, description,
#> #   author, source [1,000]
#>    id         name  md5sum submission_date last_update_date description bed_ids 
#>    <chr>      <chr> <chr>  <chr>           <chr>            <chr>       <list>  
#>  1 encode_ba… enco… 462ea… 2025-04-25T01:… 2025-04-25T01:4… "Encode pr… <tibble>
#>  2 encode_ba… enco… f6f15… 2025-04-24T23:… 2025-04-24T23:3… "Encode pr… <tibble>
#>  3 encode_ba… enco… cf9f5… 2025-04-27T03:… 2025-04-27T03:1… "Encode pr… <tibble>
#>  4 encode_ba… enco… 50cba… 2025-04-30T05:… 2025-04-30T05:3… "Encode pr… <tibble>
#>  5 encode_ba… enco… 6054b… 2025-04-28T22:… 2025-04-28T22:2… "Encode pr… <tibble>
#>  6 encode_ba… enco… 59f42… 2025-04-29T06:… 2025-04-29T06:2… "Encode pr… <tibble>
#>  7 encode_ba… enco… 1cd93… 2025-05-02T20:… 2025-05-02T20:5… "Encode pr… <tibble>
#>  8 excludera… excl… f6826… 2025-05-05T18:… 2025-05-05T18:3… "Exclude r… <tibble>
#>  9 gse100000  gse1… 3da66… 2025-06-01T14:… 2025-06-01T14:5… "Data from… <tibble>
#> 10 gse100302  gse1… a8df0… 2025-05-23T03:… 2025-05-23T03:4… "Data from… <tibble>
#> # ℹ 990 more rows
#> # ℹ 2 more variables: author <chr>, source <chr>