List BEDsets — bb_list_bedsets • bedbaser

List BEDsets available through bedhost. By default uses the bedhost default of 1000 records and an initial offset of 0.

bb_list_bedsets(bedbase, query = "", limit = 1000, offset = 0)

Arguments

bedbase: BEDbase() object
query: character() (default "") keyword
limit: integer(1) (default 1000) maximum records
offset: integer(1) (default 0) page token of records

Value

tibble of BEDset records

Examples

bedbase <- BEDbase()
#> 663721 BED files available.
bb_list_bedsets(bedbase)
#> # A tibble: 1,000 × 9
#>    id    name  md5sum submission_date last_update_date description bedfile_count
#>    <chr> <chr> <chr>  <chr>           <chr>            <chr>               <int>
#>  1 gse1… gse1… b4caf… 2025-06-01T23:… 2025-06-01T23:1… "Data from…             8
#>  2 gse1… gse1… 353f1… 2025-06-02T20:… 2025-06-02T20:3… "Data from…             1
#>  3 gse1… gse1… f1941… 2026-02-11T02:… 2026-02-11T02:5… "Data from…             5
#>  4 gse1… gse1… 9e77a… 2025-06-01T22:… 2025-06-01T22:4… "Data from…             3
#>  5 gse2… gse2… 0c7b2… 2025-06-02T18:… 2025-06-02T18:3… "Data from…             1
#>  6 gse1… gse1… c1a7d… 2026-02-11T03:… 2026-02-11T03:0… "Data from…             4
#>  7 gse1… gse1… 3bfdb… 2025-06-01T22:… 2025-06-01T22:5… "Data from…             6
#>  8 gse1… gse1… e7d73… 2026-02-11T03:… 2026-02-11T03:0… "Data from…             1
#>  9 gse1… gse1… b4542… 2026-02-11T03:… 2026-02-11T03:0… "Data from…             1
#> 10 gse1… gse1… da294… 2026-02-11T03:… 2026-02-11T03:0… "Data from…             4
#> # ℹ 990 more rows
#> # ℹ 2 more variables: author <chr>, source <chr>