List BEDsets — bb_list_bedsets • bedbaser

List BEDsets available through bedhost. By default uses the bedhost default of 1000 records and an initial offset of 0.

bb_list_bedsets(bedbase, query = "", limit = 1000, offset = 0)

Arguments

bedbase: BEDbase() object
query: character() (default "") keyword
limit: integer(1) (default 1000) maximum records
offset: integer(1) (default 0) page token of records

Value

tibble of BEDset records

Examples

bedbase <- BEDbase()
#> 663721 BED files available.
bb_list_bedsets(bedbase)
#> # A tibble: 1,000 × 9
#>    id    name  md5sum submission_date last_update_date description bedfile_count
#>    <chr> <chr> <chr>  <chr>           <chr>            <chr>               <int>
#>  1 gse1… gse1… 4683d… 2025-05-25T00:… 2025-05-25T00:4… "Data from…             8
#>  2 gse2… gse2… 156b7… 2025-05-24T15:… 2025-05-24T15:4… "Data from…            10
#>  3 gse2… gse2… d8da9… 2025-05-25T00:… 2025-05-25T00:2… "Data from…             4
#>  4 gse2… gse2… dd126… 2025-05-25T00:… 2025-05-25T00:3… "Data from…             8
#>  5 gse2… gse2… 4215f… 2025-05-24T16:… 2025-05-24T16:1… "Data from…            16
#>  6 gse2… gse2… d8da9… 2025-05-25T00:… 2025-05-25T00:3… "Data from…             4
#>  7 gse9… gse9… 1bc15… 2025-05-24T15:… 2025-05-24T15:5… "Data from…             4
#>  8 gse1… gse1… 7ca99… 2026-02-09T13:… 2026-02-09T13:5… "Data from…             1
#>  9 gse9… gse9… cffd0… 2026-02-07T08:… 2026-02-07T08:4… "Data from…             2
#> 10 gse1… gse1… a46a2… 2026-02-09T14:… 2026-02-09T14:0… "Data from…             3
#> # ℹ 990 more rows
#> # ℹ 2 more variables: author <chr>, source <chr>