List BEDsets — bb_list_bedsets • bedbaser

List BEDsets available through bedhost. By default uses the bedhost default of 1000 records and an initial offset of 0.

bb_list_bedsets(bedbase, query = "", limit = 1000, offset = 0)

Arguments

bedbase: BEDbase() object
query: character() (default "") keyword
limit: integer(1) (default 1000) maximum records
offset: integer(1) (default 0) page token of records

Value

tibble of BEDset records

Examples

bedbase <- BEDbase()
#> 665778 BED files available.
bb_list_bedsets(bedbase)
#> # A tibble: 1,000 × 9
#>    id    name  md5sum submission_date last_update_date description bedfile_count
#>    <chr> <chr> <chr>  <chr>           <chr>            <chr>               <int>
#>  1 enco… enco… 462ea… 2025-04-25T01:… 2025-04-25T01:4… "Encode pr…           994
#>  2 enco… enco… f6f15… 2025-04-24T23:… 2025-04-24T23:3… "Encode pr…           997
#>  3 enco… enco… cf9f5… 2025-04-27T03:… 2025-04-27T03:1… "Encode pr…          1989
#>  4 enco… enco… 50cba… 2025-04-30T05:… 2025-04-30T05:3… "Encode pr…          1985
#>  5 enco… enco… 6054b… 2025-04-28T22:… 2025-04-28T22:2… "Encode pr…          1980
#>  6 enco… enco… 59f42… 2025-04-29T06:… 2025-04-29T06:2… "Encode pr…          1985
#>  7 enco… enco… 1cd93… 2025-05-02T20:… 2025-05-02T20:5… "Encode pr…          3592
#>  8 enco… enco… 5474e… 2026-04-11T14:… 2026-04-11T14:4… "All encod…         35707
#>  9 enco… enco… 6794e… 2026-04-11T15:… 2026-04-11T15:2… "All encod…         32844
#> 10 enco… enco… e6af8… 2026-04-11T10:… 2026-04-11T10:4… "All encod…         34244
#> # ℹ 990 more rows
#> # ℹ 2 more variables: author <chr>, source <chr>